保密工作管理体制主要由保密行政管理部门和保密工作机构组成，保密行政管理部门包括国家保密行政管理部门和地方各级保密行政管理部门。国家保密行政主管部主管全国的保密工作，县级以上地方各级保密行政管理部门主管本行政区域的保密工作。

保密工作机构，是指根据机关、单位的职权范围进行保密管理或指导的内设工作部门。中央和国家机关、地方各级党政机关以及国有企业事业单位保密委员会，一般都成立保密工作机构负责日常保密管理工作，如保密办、保密处，或者指定某个部门负责。

中央和国家机关保密工作机构的职责是管理本机关的保密工作，并对本系统的保密工作进行管理或者指导。这种管理或者指导，应当与业务工作管理关系保持一致。业务工作接受上级业务部门垂直管理的单位，保密工作以上级业务部门管理为主，同时接受地方保密行政管理部门的指导，业务工作接受上级业务部门指导的单位，保密工作以地方保密行政管理部门为主，同时接受上级业务部门的指导。